Dateien, die eine Verschlüsselungsmethode verwenden, um ihren Inhalt zu speichern, werden als „codiert“ bezeichnet. Zu dieser Kategorie gehören sowohl verschlüsselte als auch unkomprimierte Archive sowie binär codierte Textdateien. Bei der Übertragung von Daten ist es üblich, Dateien aus Sicherheits- und Stabilitätsgründen zu verschlüsseln.